四月十二日。
太皇太后原本打算采用蘇軾昨日的建議,，先以宋哲宗的名義立案審查,，然后再寬恕蔡確，然而事情的走向隨著詔令的下發(fā)后發(fā)生了偏差,。詔令命安州衙門取來蔡確詩文原稿,，同時將官員彈劾蔡確的內容告知于他，允許他上章自辯,。此詔令一出,，滿朝嘩然。
翌日,。
中書舍人彭汝礪上書啟奏,，聽聞吳處厚說蔡確作詩涉嫌譏謗，朝廷下旨讓蔡確自辯,。詔令一出,，議論紛紛。自己夙夜反復思慮,，以至于廢忘寢食,，實在想不通朝廷這么做是何道理，乞盼朝廷趁著詔令還未走遠,，盡快廢除,，再行下旨。
緊接著,，梁燾,、吳安詩、劉安世也相繼多次上書彈劾蔡確,，言辭激切,，請求朝廷對其嚴懲。
與此同時,，安州衙門那邊也傳來了回信,，蔡確所作詩，初題在牌上,，然后移至鄧州,，走了一驛的距離后，安州衙門派人取回牌子,，上交公使庫,。
而蔡確的自辯奏章也同時被送達汴京，呈送御前,。蔡確奏章中寫道：臣在安州作詩涉嫌譏訕,，朝廷下詔讓臣啟奏此事。他們說我被貶安州,，包蓄怨心,，公然肆無忌憚地在詩篇中譏謗，這是臣僚橫加誣陷，欲以激怒朝廷,，而不知當時處置的始末,，妄加猜測臣在怨恨。
臣前年夏天在安州,，所居住的西北角,，有一座舊亭，名為車蓋亭,，下臨涢溪，上與白兆山相對,。臣處理完公事后就在車蓋亭上休息,，觀賞此景，偶然詩興大發(fā),，作了數首小詩,，沒有一句一字涉及時事，也沒有對貶謫有不滿之意,。詩意淺顯,，讀一下便可知曉，不料臣僚卻在詩的意思之外多方注釋,，橫加誣蔑,，說我有隱晦之意。如果真是這樣,，那么尋常人開口落筆,，雖沒提及某事，都可以用某事來治他的罪,，說他有隱晦之意……
蔡確在奏章中將官員彈劾其詩文中的譏諷之意一一辯解,，還說古今詩句用海變桑田事的人特別多，就像近些年蘇軾在坤成節(jié)大宴上致語也說“欲采蟠桃歸獻壽,，蓬萊清淺半桑田”,，祝壽之辭都用這些，為何臣吟詩用此舊事就不是佳句,？
數日后,。
由于蔡確的奏章提到了蘇軾的詩句引用“桑田”，劉安世,、梁燾與同僚又議論起蘇軾當年被李定等人誣蔑譏諷的“海變桑田事”,。很快，蘇軾又被人彈劾諸多罪狀,，此事傳入蘇軾耳中,，他急忙于四月十七日上章自辯，以證清白，并表示如果再有人彈劾自己,，請朝廷將彈劾奏章外付施行,。
蘇軾隱約感覺到再不走只怕自己也會被卷入車蓋亭一案，急忙帶著全家遠離這個是非之地,，前往杭州赴任去了,。
由于御史中丞李常和侍御史盛陶不太想參與，結果遭到梁燾,、劉安世等人的彈劾,。梁燾指責李常、盛陶表面上意圖護佑蔡確,，實則是想要治吳處厚的罪,，而劉安世則彈劾兩人身為御史，目睹蔡確無禮于君親,，卻在觀望,，不上書彈劾。
與此同時,，中書舍人彭汝礪上書營救蔡確,，又遭到了梁燾等人的彈劾。沒多久,，吳安詩又彈劾中書舍人曾肇教唆彭汝礪營救蔡確,，自己卻不上書，其奸惡程度超過彭汝礪,。
數日后,。
延和殿。
太皇太后對蔡確之事心力交瘁,，召集文彥博,、與呂大防、范純仁等三省宰相們一同商議此案,，不禁感慨道：“要是司馬君實在,，必不至于這樣?！?p> 文彥博等人不知如何接話,，只得面面相覷。
隨后幾日,，太皇太后又召集范純仁,、呂大防、劉摯商議,，感慨道：“蔡持正在朝中有很多朋黨?。 ?p> 范純仁自從回朝后就一直希望調和各派，聽聞太皇太后如此一說,，搶先回應道：“蔡持正沒有朋黨,。”
呂大防反駁道：“蔡持正確實有朋黨在朝,，范堯夫所言不對,。”
劉摯隨聲附和道：“呂微仲所言極是,，蔡持正確實有朋黨,。”
三人爭執(zhí)不下,，太皇太后甚為煩躁,，只得隨后再議。
五月,。
朝廷下詔龍圖閣直學士,、御史中丞李常為兵部尚書,，朝奉大夫,、侍御史盛陶為太常少卿。蔡確責授左中散大夫,、守光祿卿,、分司南京。詔令一出,，再度引發(fā)朝中熱議,。
彭汝礪作為中書舍人拒擬草招，并上書乞求朝廷對其予以寬恕,。
梁燾,、吳安詩、劉安世認為處罰得太輕了,，上書請求朝廷對其予以重判,，并指責彭汝礪沒有學術，妄自尊大,，誕謾愚人,，以邀虛譽，與曾肇一心為惡,，時常懷念蔡確的私恩,，朝夕盼望其回朝；而曾肇尤其陰險狡詐,，借著草擬詔書的權利,，用官家的話抒發(fā)愛憎，上侮人主，下結奸臣,，欺君賣國,，人神共怒，官家卻對此茫然不知,。
御史中丞傅堯俞,、侍御史朱光庭、右諫議大夫范祖禹等人也跟著相繼彈劾蔡確,。至此,，諫院、御史臺大多數言官都參與到了車蓋亭一案中,，而殿中侍御史翟思,、監(jiān)察御史趙挺之以及王彭年因為不想參與，沒有上書彈劾遭到了和之前李常,、盛陶一樣的下場,。
數日后。
在臺諫官們的不斷彈劾下,，朝廷下詔,，殿中侍御史翟思任宣州通判，監(jiān)察御史趙挺之任徐州通判,，王彭年任廬州通判,，而之前已被改任侍御史、太常少卿的盛陶再次被改任汝州知州,，已被改任龍圖閣直學士,、兵部尚書的李常又被改任鄧州。
詔令一出,，尚書左丞王存啟奏道：“臣以為不應責罰盛陶等人,，如果因為不諫言就責罰御史，恐怕后來者會不擇而言,，只為逃避責罰,。
太皇太后道：“臺諫言多諫言有什么害處呢？只要朝廷能明辨是非即可,?！?p> 王存只得作罷。
與此同時,，在被臺諫官們連續(xù)攻擊下,，朝廷下詔，中書舍人彭汝礪改任朝奉郎,、徐州知州,，中書舍人曾肇本來改任給事中,，因其請求離京外任，遂改任寶文閣待制,、潁州知州,。
車蓋亭一案并沒有因為蔡確被貶而平息，反而越鬧越大,，尚書,、中書、門下三省,、諫院,、御史臺等部門全部參與其中。