就在后金撤退以后,，朱由檢為了加緊部署圍剿農(nóng)民軍,。令洪承疇擔(dān)任河南總督負(fù)責(zé)圍剿河南起義軍又升孫傳庭為陜甘邊總督負(fù)責(zé)圍剿巴蜀起義軍，又給湖北墨舟下達(dá)命令準(zhǔn)備執(zhí)行盧象升的拉網(wǎng)戰(zhàn)略,。
?即洪承疇集結(jié)明軍精銳由開封南下向西運(yùn)動將林云起義軍流竄到信陽一線直接與墨舟部隊(duì)南北夾擊殲滅在信陽,。
?陜西孫傳庭方面則發(fā)起漢中之戰(zhàn)繼而攻克漢中一舉配合云南沐家收復(fù)四川，為防止大西軍逃竄令墨舟留一部三萬兵力正面在湘西牽制大西軍,，其余主力則從長江西岸入重慶展開圍剿,，一舉堵住大西的出逃之路。
?此時崇禎帝打算變法,，就在各部執(zhí)行對大西的戰(zhàn)略之際,，朱由檢召見孫承宗詢問變法之事。
?朱由檢打算效仿商鞅,，進(jìn)行商鞅變法,，
改革。他決定將變法推廣到全國范圍內(nèi),。變法最大的難題就是沒有一個合適的人選去執(zhí)行變法,。因?yàn)榇竺鞯娜瞬哦技性陉兾骱秃V，這兩地缺乏政治人才,，所以變法的成功性不足百分之九十九,。朱由檢也清楚這一點(diǎn)。所以,，他打算讓孫承宗去做這件事,，他相信以孫承宗的學(xué)識和才干肯定能完成這項(xiàng)艱巨的任務(wù)。
變法主要內(nèi)容有
兩項(xiàng),，一個是變法,，一個是制裁。制裁的內(nèi)容是改革,，變法則是改革,。變法的主要內(nèi)容包括了：第一項(xiàng)是改革，改革就是改變官吏的階級地位,，使得階級地位提升起來,，而不再是依附于商人,，商人也會依賴階級地位而。第二項(xiàng)是改革,，改革就是對階級地位進(jìn)行清洗,。這項(xiàng)工作的難度比較大，畢竟官吏的級別和品級都太高了,。將商人集團(tuán)直接殺絕,，抄了他們的財富，抽了他們的稅,。所謂官僚階級就是將官員集團(tuán)徹底打壓,，然后逐漸削弱官僚階層。在朱由檢看來,，變法的最大阻礙其實(shí)并非階級地位,。而是人才，官員階級是一個體系的基石,，而人才的培養(yǎng)則更需要資源,。所以朱由檢要將官員階級清除，同時削弱官僚階級,，以減輕官僚階級的影響力,。當(dāng)初，朱由檢就是利用變法打壓商賈階級,，同時將官吏階級清掃,。這樣做的弊端是很大的，那就是官僚階層在變法中的作用太大了,，這會影響到官場形勢的穩(wěn)定,，會使得大明朝廷出現(xiàn)混亂，甚至是崩潰,。不過朱由檢相信以孫承宗的才華和才能,，他一定可以做到。所以朱由檢在孫承宗來京城之前便下令孫承宗調(diào)集兵馬在京城駐扎防止叛亂,。
4月,，變法開始后，孫承宗帶兵抄了京城的商人,，
將他們手上的商鋪,、田產(chǎn)、土地等全部充公,，使得京城的商人,、士紳們失業(yè)了。而且他還讓他的心腹將商人的家屬,、親朋好友抓走,。這使得京城的商人、士紳們惶恐不已,。群臣炸鍋了紛紛反對,，上書說這樣會毀了大明。
朱由檢聽到上書說會毀了大明,，當(dāng)即怒火沖天,，拍案而起道：“你們以為朕不知道，你們不就是擔(dān)心變法嗎,？不就是擔(dān)心錢財會被官府侵吞,，所以不希望朕變法嗎？,！現(xiàn)在朕就告訴你們,。朕要變法！朕要讓大明的百姓過上富裕的生活,！朕已經(jīng)下旨,，將京城的商人家眷以及親戚家的田莊等土地全部征收。你們?nèi)羰窃俑曳纯?，休怪朕無情,！“眾臣見朱由檢態(tài)度堅(jiān)決只好閉嘴。但是眾臣也沒有放棄,，繼續(xù)在朝堂上上書勸諫,，“皇上，臣建議您立刻收回成命,，否則這樣做會損壞大明的根基,，甚至?xí)＜盎饰弧,！啊皩Π,。』噬?，臣認(rèn)為應(yīng)該暫時停止變法,。““皇上,，臣以為不妥,。““臣認(rèn)為這樣做是錯誤的,?！俺蒙弦黄臭[聲。朱由檢聽得煩悶異常,，他冷哼了一聲,，說道：“都給朕閉嘴,！不想死的就給朕安靜！朕已經(jīng)下旨,，誰要是再敢反抗朕,。就不必進(jìn)宮見朕了?！爸煊蓹z說罷就站了起來拂袖而去,，大殿中頓時鴉雀無聲，眾人不敢多說一句話,。孫承宗在一旁默不作聲,，此時他內(nèi)心非常激動，因?yàn)樗吹街煊蓹z的決心了,，這是要變法?。O承宗知道,，變法一旦成功必將震驚天下,。朱由檢走了一會兒，忽然停下腳步,。轉(zhuǎn)身看著孫承宗說道：“孫愛卿,，這幾天你辛苦了?！皩O承宗急忙躬身說道：“微臣為陛下分憂是微臣應(yīng)該做的,。陛下，這幾日微臣正在整理變法的內(nèi)容,。相信不久后就能夠完成,。“朱由檢點(diǎn)了點(diǎn)頭,。孫承宗又說道：“微臣已經(jīng)整理出一份變法綱要,，微臣認(rèn)為可以交給陛下審閱?！啊芭?？“孫承宗拿出了一張紙遞給朱由檢。朱由檢打開一看,，頓時眼睛瞪圓了,，只見紙上列出了變法的諸多細(xì)節(jié)，這些細(xì)節(jié)都是朱由檢不曾注意的地方,，朱由檢一邊翻看,，一邊贊嘆道：“孫愛卿，你這份綱要很詳盡??！朕都沒有看過這份綱要,，沒想到孫愛卿你已經(jīng)將變法的內(nèi)容弄的如此透徹，真乃朕的賢臣??！“孫承宗笑著謙虛的說道：“皇上，這都是為了大明著想,，為了讓天下人過上幸福生活。這篇變法綱要可謂是一箭雙雕??！“朱由檢哈哈大笑，連聲稱贊道：“不錯,，不錯,！孫愛卿，這份綱要寫的太好了,。
此時緊急奏本,，不好了東城發(fā)生了叛亂，報不好了天津衛(wèi)反了,，
失守,，報不好了山東發(fā)生了暴亂......““什么？,！東城發(fā)生了暴亂,？！山西發(fā)生了暴亂,？,！“朱由檢一臉愕然，一臉驚訝的看著孫承宗,?！皩Π |城發(fā)生了暴亂,，這都才五天,，一直都沒有消息傳來。
陛下,，大臣們集體到宣政殿要求處死孫承宗,，
孫承宗跪倒在地，一臉悲憤的懇求著朱由檢,。陛下,，臣意識到這變法是錯誤的，請放了他們
吧,，他們不能因?yàn)橐患核接鴼Я舜竺鞯母?！臣知道這次是臣錯了,，臣愿意領(lǐng)罪?！啊邦I(lǐng)罪,？你領(lǐng)什么罪？“朱由檢冷笑道,?！氨菹拢家詾樽兎☉?yīng)該停止,，如果變法成功的話,，會對整個大明造成極大的傷害，會導(dǎo)致整個大明朝綱動搖,?！皩O承宗跪拜在朱由檢腳下懇切的說道?！肮?.....孫承宗啊孫承宗,，你可知道你這番話會引來什么樣的結(jié)局嗎？,！你這是造反,！你這是要背叛朕啊,！“朱由檢指著孫承宗的鼻子破口,，不變根本無法救大明，起義軍還是會卷土重來關(guān)外后金還是會入關(guān)的,！而變法只要成功了,，他就能保住大明！“臣......臣......臣......臣沒有造反,，臣......“朱由檢一巴掌扇在孫承宗臉上,，孫承宗頓時跌坐在地，捂著臉痛呼,。朱由檢發(fā)泄怒火后,，冷靜下來如果這次妥協(xié)將來一定會被東林黨所傀儡，到時候就麻煩了,。朱由檢不能讓東林黨掌控大明的朝政,。孫承宗爬起來說道：“臣知錯，臣不該提這茬,，臣這里還有一份變法的綱要,。“孫承宗急忙拿出另外一份文書呈給了朱由檢，孫承宗心里很清楚,，他這份文書的價值比剛才的文書更大,。孫承宗遞上去文書，朱由檢一臉疑惑的接過文書,，打開仔細(xì)讀起,。孫承宗看到朱由檢在閱讀，于是悄悄退了下去,，等待朱由檢的召見,。一盞茶后，朱由檢看完了變法的所有內(nèi)容,。至于群臣跪諫讓他們先跪著,。朱由檢卻并未下旨讓他們退下。而是一臉凝重的思索起來,。他的臉色也隨著文章的閱讀變幻莫測?！皩O愛卿,，這篇文章寫的確實(shí)很不錯。
論變法
一,、
變法不應(yīng)該是在朝堂上討論,，而是在民間。民間可以自主選擇變法,，可以組織民團(tuán),，可以在任何時候任何場合都可以組織。但絕不能在大街上,，在朝廷官員面前表演變法的內(nèi)容,。二、變法不可以以武力強(qiáng)行推廣,，應(yīng)該適當(dāng)?shù)牟扇∫恍厝崾侄?，不能以暴力解決問題。三,、變法不應(yīng)該用刀劍和殺戮來威脅人民,，更不應(yīng)該用暴力來逼迫人民。四,、變法要采用各種手段,，不可以用暴力來鎮(zhèn)壓人民。不管是什么,，一定要用和平的手段,，讓老百姓們感受到和平的美好。五、變法應(yīng)該通過文學(xué),，通過科舉考試來進(jìn)行,，不應(yīng)該用武力強(qiáng)加于人，要讓百姓知道我大明是個講究科舉的時代,。
朱由檢閱完后,，怒道：那該怎么變法！
怎么才能夠讓百姓們感受到和平,？“孫承宗聽到朱由檢的怒吼聲后,，嚇的心跳差點(diǎn)停止。他急忙低下了頭,，一聲也不吭,。“朕讓你回答朕的問題,，你卻不回答,。“朱由檢見孫承宗沉默了,，怒罵道,。孫承宗抬起頭，看向朱由檢,，低聲說道：“陛下,，孫承宗以為變法應(yīng)該以治國之道為主。變法首先是改善人民的飲食,，改善民生,。變法可以讓民間的百姓們知道朝廷對他們都是很好的。變法應(yīng)該讓他們明白大明是世界上最強(qiáng)大的王朝,，讓他們知道……,。
朱由檢龍顏大怒！滾,！
朕不想再看到你,！“孫承宗嚇的急忙磕頭離開了御書房。朱由檢看到孫承宗離開后,，心里越發(fā)惱火,，他覺得自己的權(quán)利受到了侵犯。孫承宗的意見是對的,，但是在朱由檢看來卻是錯誤的但是不管那么多了,！
他決定不再繼續(xù)任用孫承宗，孫承宗的所作所為讓他感到深深地厭惡,?！皩O承宗啊孫承宗，朕原本以為你忠心耿耿，沒有想到,，你居然會背著朕做出這樣的事情來,！朕現(xiàn)在終于知道為什么朕會敗給李自成了，就是因?yàn)槔钭猿杀葘O承宗聰明,，比孫承宗狡猾,，孫承宗雖然也是一員猛將，但他太過魯莽,，做事總喜歡按照自己的想法來做,，而且還總是喜歡將責(zé)任推卸到別人的身上，李自成做事謹(jǐn)慎,，心機(jī)深沉,，他從來不把任何人的命運(yùn)放在眼中，他可以將你玩弄與鼓掌之間,，你卻拿他毫無辦法,！孫承宗，你真是愚蠢,！“朱由檢越想越氣,，他一拍桌子，大聲喝道：“來人,！來人,！““奴婢在,！“宮女急忙跑進(jìn)來,。朱由檢一臉怒容，喝道：“將孫承宗打入天牢,！““諾,！“
至于群臣松了一口氣孫承宗一路哀嚎著走進(jìn)了大理寺。孫承宗在大理寺的牢獄中受盡折磨,，他的衣衫破爛不堪,，臉上血跡斑駁，頭發(fā)凌亂不堪,，渾身上下都帶著傷痕,，看上去非常凄慘。孫承宗在大理寺的牢獄里一呆就是半個月,。