小智三人走在旅行的路上,，小智一邊走路一邊回憶著劇情：妙蛙種子，小火龍,，下一處是杰尼龜軍團(tuán)了,。想到杰尼龜軍團(tuán)，小智突然停下了腳步,，對皮卡丘說道：“皮卡丘,，麻煩你對前面的路掃蕩下，十萬伏特,?！逼たㄇ痣m然不懂為什么，但還是釋放出十萬伏特將眼前的草叢掃蕩了一下,，小智看著出現(xiàn)的一個個坑,，心說：果然如此！

　　就在這時,，一群杰尼龜突然出現(xiàn),，在小智一行人還沒反應(yīng)過來，釋放了水槍,，把小智一行人淋成了落湯雞,。

　　這可把小霞惹火了，只見小霞怒氣沖沖地對杰尼龜軍團(tuán)吼道：“可惡??！你們這群杰尼龜是怎么回事啊,？這么沒禮貌,！”吼完后就要去教訓(xùn)這群杰尼龜,，小智立馬伸手拉住小霞：“冷靜一下。我看這些杰尼龜沒什么惡意,。就是喜歡惡作劇,。”

　　這時警笛聲從遠(yuǎn)處傳來,，而杰尼龜軍團(tuán)聽到警笛聲音感到不妙,，就立刻都逃跑了。君莎小姐趕到后第一時間關(guān)心起小智一行人的安全：“你們都沒事吧,？”小霞生氣地回答道：“怎么沒事,？沒看見我們?nèi)齻€人都成了落湯雞了嗎？”小智揺手表示沒事,，小剛則難得地沒犯花癡,，只是問了一下：“君莎小姐，請問那些杰尼龜是怎么回事,？”

　　君莎小姐和小智一行人邊走邊說道：“那些杰尼龜都是曾經(jīng)被訓(xùn)練家拋棄的寶可夢,，后來走到一起，組成了杰尼龜軍團(tuán),，到處搞亂，惡作劇,。比方說在房屋墻壁上涂鴉,，搶劫水果之類的事情?！闭f完,，嘆了口氣，感慨道：“要是當(dāng)初遇上好的訓(xùn)練家就好了,！”

　　聽到這里,，小智也有所觸動，因為被自己收服了的寶可夢都有類似情況,。小霞也不生那些杰尼龜?shù)臍饬?，畢竟所謂的杰尼龜軍團(tuán)也只是群搞蛋鬼而已。

　　就這樣,，小智一行人跟著君莎小姐來到了一個小鎮(zhèn)上,，小智從君莎小姐的口中得知了杰尼龜軍團(tuán)就是在這里聚集的，君莎小姐還要小智一行人小心點,，別中了杰尼龜軍團(tuán)布置的陷阱,。小智一行人也都點了點頭，示意自己知道,。隨后,，君莎小姐以公務(wù)為由,，和小智一行人分開了。

　　就在小智一行人和君莎小姐分開不久,，一不留神就中了個陷阱,，不過這次不是杰尼龜軍團(tuán)，而是老熟人——火箭隊挖的,。中了陷阱后,，小智問道：“這里怎么有陷阱啊,？”

　　“……（火箭隊經(jīng)典登場臺詞）”

　　小次郎率先說道：“這次你們中了陷阱,，奉勸一句：乖乖地把皮卡丘交出來！”武藏附和道：“沒錯,，我們只要皮卡丘,。”看到火箭隊沒做防電措施,，小智立刻讓皮卡丘攻擊：“皮卡丘,，使用十萬伏特吧！”

　　在一聲“好討厭的感覺??！”的叫喊聲中，火箭隊又被趕跑了,。小智一行人也乘機從陷阱中出來,。

　　從陷阱中出來的小智一行人發(fā)現(xiàn)自己已經(jīng)被杰尼龜軍團(tuán)包圍了，見自己被杰尼龜包圍了,，小智和小霞知道必須將這些杰尼龜收服才行,，小剛則對這些杰尼龜不感興趣，所以只有小智和小霞放出自己的寶可夢來戰(zhàn)斗,。

　　小智派出皮卡丘,，對戰(zhàn)杰尼龜中的老大，小霞則派出自己的寶石海星,，和其它杰尼龜戰(zhàn)斗,。小剛則看著小智和小霞。

　　“皮卡丘,，使用十萬伏特,。”

　　“寶石海星,，我們也使用十萬伏特,。”

　　就這樣，杰尼龜們一點反抗都沒有,，就被皮卡丘和寶石海星的十萬伏特電暈了,，小智收服了杰尼龜?shù)睦洗螅∠紕t將其它杰尼龜收服了,，不過,，小霞的杰尼龜全都被傳回了華藍(lán)道館，小智則把超音蝠傳回去了,，杰尼龜留在小智的身上,。

　　杰尼龜軍團(tuán)解決，小智一行人接著踏上旅途,。