木葉39年,，自第二次忍界大戰(zhàn)徹底爆發(fā)的兩年后,，此時戰(zhàn)爭已經(jīng)臨近尾聲，各國之間的兵力損傷慘重,，經(jīng)濟倒退,，已無力再維持戰(zhàn)爭。
云隱,、巖隱,、霧隱紛紛結(jié)束戰(zhàn)爭,。只有木葉、砂隱,、雨隱三村還在繼續(xù)戰(zhàn)斗,。
木葉接近三千人的戰(zhàn)斗部隊，除去陣亡,、重傷人員之外,，如今只剩下了一千人。甚至連木葉另外上千人的后勤部隊,，也在敵村偷襲之下死傷過半,。
作為占據(jù)上風的木葉村尚且損失如此，其他村子的損傷只會更大,。
這兩年里,，不斷的有人偷襲暗殺旗木兄弟倆人。各種各樣的暗殺手法,，在兄弟二人吃飯時,、睡覺時、巡邏時,、甚至連上廁所時都被暗殺過,。花樣頻出的暗殺讓兄弟二人防不勝防,，火影派來保護兄弟二人的護衛(wèi),，也在保護過程中死的死傷得傷。
后來才知道是風影給旗木兄弟二人,，開出了價值八千萬的天價懸賞金導致的被暗殺,。于是在三個月前與砂隱村的最后一戰(zhàn)中，憤怒至極的兄弟二人,，火力全開,，矛頭直指向三代風影。
在殺死風影身邊的二十名護衛(wèi)后,，兩把忍刀,，黑玉和白牙，一前一后的刺穿了三代風影的心臟,。就在三代風影臨死前,，釋放出了極其可怕的一招，磁遁·砂鐵界法,！
漫天的砂鐵在空中形成大型帶長刺的結(jié)界進行穿刺攻擊,。無數(shù)道砂鐵長矛刺穿了雷遁之鎧，旗木兄弟二人即使憑強大的肉體也擋不住那砂鐵長矛，于是旗木兄弟二人被刺的滿身血窟窿,。
好在隨著三代風影的陣亡,，砂鐵才漸漸消散不見。砂隱的忍者們看到三代風影已死,，知道和木葉的一仗敗了,，紛紛開始后退撤兵。
旗木兄弟在刺殺三代風影后,，身受重傷,，暈倒在戰(zhàn)場之中。綱手給旗木兄弟治療過后,，已無大礙,，只需要靜靜修養(yǎng)即可。
于是猿飛日斬派遣了十二位暗部成員,，精心保護正病床上修養(yǎng)的木葉英雄,，黑白獠牙兄弟。
這場第二次忍界大戰(zhàn),，本來的目的就是各大國為了擴張土地,，掠奪資源而發(fā)起的。云隱,、巖隱,、霧隱三方在小國家，音之國附近爭斗,。而木葉,、砂隱則以雨隱村為戰(zhàn)場。
眼看砂隱退兵,，眼前敵手只剩下雨隱村了,。機不可失,，猿飛日斬急忙想要派兵攻打雨隱村,。
但因旗木兄弟二人重傷未愈，還躺在病床之中,。于是猿飛日斬的可用之人只剩下綱手,、自來也、大蛇丸三人,。
綱手,、自來也、大蛇丸三人,，率領(lǐng)了三百個木葉忍者攻向雨隱村,。而雨隱村這個小勢力，被夾在大國爭斗之中也死傷慘重，此時還能堅持戰(zhàn)斗的忍者只剩下區(qū)區(qū)三十人而已,。
兩邊人馬在雨隱村街道對峙,，隨著綱手一聲令下，木葉的三百名忍者紛紛沖上前去戰(zhàn)斗,。兩邊忍術(shù)紛飛,，場中再次充滿了風火雷土水各種屬性。
一時間雨隱村周圍房屋盡數(shù)坍塌,，煙霧彌漫,，塵土飛揚。雨隱還活著的忍者越來越少,，畢竟對面的人數(shù)是自己的十倍,。木葉忍者看到對方已經(jīng)敗退，正紛紛發(fā)起沖鋒,。
然后被人們尊稱為【半神】的山椒魚半藏出手了,，火遁·起爆炎陣！只見地面下出現(xiàn)了無數(shù)起爆符,，在半藏的控制之下纏住了木葉忍者的腿,。
接著起爆符嘭嘭嘭的爆炸，上百名忍者接連斷肢倒地,，哭嚎不止,。在起爆符升起的時候，大蛇丸和自來也已經(jīng)提早感知到并躲開,，而綱手的感知能力稍差,。
就在起爆符升起在綱手腿邊要爆開時，忍法·針地藏,！原來自來也的頭發(fā)變?yōu)榱藞皂g的鎧甲,，將綱手護在其中?？上鸨μ^強勁,，綱手的腿還是被炸的血流不止。
綱手馬上使用醫(yī)療忍術(shù)·掌仙術(shù)止血,，隨后自來也與大蛇丸二人攻向了山椒魚半藏,。
忍法·潛影蛇手！
忍法·針地藏,！
大蛇丸的手臂化為數(shù)十道白蛇,，隨自來也如針一般的頭發(fā)，兩道攻擊一起打到了山椒魚半藏身上,。就在二人以為攻擊得手時,，半藏被攻擊到的身體變?yōu)橐粸┧瓉硎撬采碇g(shù)！
綱手那邊已經(jīng)臨時止血,，加入戰(zhàn)局,，三人一同尋找半藏的身影。原來此時半藏已經(jīng)跳到了空中,，從天而降,，舉起手中劇毒的鐮刀劈向大蛇丸，大蛇丸急忙使用土流壁擋下攻擊,。
接著半藏落地就使用了通靈之術(shù)·山椒魚·井伏,，召喚出一個巨大的山椒魚正在吐毒。山椒魚的毒霧彌漫的非常迅速,，很快覆蓋了整條街道,。中毒的木葉忍者紛紛倒下，不久后毒發(fā)身亡,！
綱手三人則因為使用了強大的查克拉抵御毒素在體內(nèi)蔓延,，此時還能勉強堅持。綱手三人不敢再拖,，紛紛使出各自的最強招式,。
三個通靈術(shù)同時發(fā)起，場中冒起大量白煙,，待煙霧散去后,，才看見三個通靈獸的身姿。
通靈·蛞蝓,！這是綱手的通靈獸,，既可以用于治療，又可以吐出大量腐蝕性酸液攻擊敵人,。
通靈·文太,！這是自來也的通靈獸，妙木山的巨大蛤蟆,，能配合自來也使用出組合忍術(shù),。
通靈·萬蛇！這是大蛇丸的通靈獸,，龍地洞的大蛇,，移動速度飛快的同時，它的牙齒還有劇毒,。
為阻止山椒魚半藏的毒霧，綱手三人各出絕招?，F(xiàn)在綱手讓蛞蝓分裂出了三只迷你蛞蝓趴在三人肩上,，幫助治療身體，抵御毒素的影響。隨后綱手跳到山椒魚半藏面前,，單腳砸了下去,。
是怪力，痛天腳,！可惜速度不夠快,，半藏使用水瞬身之術(shù)再次避開。剛瞬身結(jié)束,，就有一道道的酸液飛來,。是蛞蝓朝著半藏的必經(jīng)之路上吐出了酸液，蛞蝓·舌齒黏酸,！
酸液的覆蓋面積太大,，躲不開的半藏只好用了一招水遁·水陣壁防御。不愧是半神,，他所使用的水陣壁不同于其他忍者,，范圍巨大，無數(shù)的水從地上噴向天空,，就好像是從下往上的逆流瀑布,。這一招不光防御住了酸液，連帶還把蛞蝓打飛,，飛出去的蛞蝓分裂成了無數(shù)小蛞蝓才分散了傷害,！
自來也此時已經(jīng)準備就緒，站在蛤蟆文太的頭上,，文太吐油,，自來也吐火。這油被火焰的高溫點著后威力十分恐怖,，這招組合忍術(shù)正是此時自來也威力最強大的一招,，火遁·蛤蟆油炎彈！
水遁·水喇叭之術(shù),！破解火遁自然要用水遁,，山椒魚半藏跳到空中，朝地面吐出喇叭般的大量水流沖擊蛤蟆油炎彈,。終于,，水還是滅了火。場中升騰起大量蒸汽,，大蛇丸藏在蒸汽中消失不見,。
落地后的半藏感知到地底有動靜，連忙再次跳開,，果然,，半藏剛才所站的地方出現(xiàn)一截尖銳的蛇尾,，不及時躲開肯定已經(jīng)被切成兩半了。
躲開了蛇尾,，還有蛇頭,！此時萬蛇的頭部從另一邊地下破土而出，咬向半藏,。半藏再次施展水瞬身之術(shù)躲開,。然而大蛇丸等的就是半藏瞬身用完的一瞬間，大蛇丸一招潛影多蛇手,，無數(shù)的白蛇飛撲而出,，咬向半藏。這是潛影蛇手的加強版,，蛇的數(shù)量變得更多,，提高了多樣性的忍術(shù)。
面對漫天蛇影無法躲避的時刻,，半藏竟然還能瞬間結(jié)印,，水遁·水斷波！從口中急速吐出超高壓的直線水柱持續(xù)切斷目標,，一轉(zhuǎn)頭,，所有的蛇都已經(jīng)被切割成為兩半，連帶蛤蟆文太和萬蛇都被打散,！蛞蝓的分裂體在這次攻擊之下也極速減少,。
水斷波攻勢不減，再次射向綱手三人,。中毒后又經(jīng)歷一番激戰(zhàn),，綱手三人查克拉都快要用光，大蛇丸勉強釋放出通靈之術(shù)·一重羅生門,！這扇巨大且堅硬的門擋在三人面前,，可惜這扇門還是被水流沖破了，但是成功的削弱了水斷波的攻擊,。
威力已經(jīng)大幅下降的水遁·水斷波還是將綱手三人擊飛倒地,，此時場中唯一站著的忍者，就只有山椒魚半藏一人而已,。
但事已至此,，半藏已經(jīng)預見到這場戰(zhàn)爭最終將以木葉村的勝利而結(jié)束，看著地上躺著的三名忍者,，都是三代火影的徒弟,，其中一個還是千手家的后代，被人尊稱為綱手公主,。
面前的三人在木葉的身份太高,，山椒魚半藏猶豫良久還是決定不能殺,，于是半藏選擇主動結(jié)束爭斗,?？粗厣咸芍娜耍b作惜才的樣子對他們說：“年輕的忍者啊,，我山椒魚半藏,，認可你們的實力了，我愿意賜予你們“木葉三忍”的稱號,?！?p> 半藏說完轉(zhuǎn)頭就走，留下“三忍”面面相覷,，不知所以,。三忍從雨隱村回去的路上，看到破亂不堪的村子,，街道上甚至沒有一棟完整的建筑,，這讓自來也心中感到愧疚不已。
戰(zhàn)爭開始的兩年來,，多國忍者部隊在雨之國境內(nèi)交戰(zhàn),，長年的戰(zhàn)爭給雨之國帶來慘痛的災難。雨之國平民身處戰(zhàn)火中心地帶,，不可避免地被卷入戰(zhàn)爭,，生命財產(chǎn)慘遭剝奪。
這時在街道深處,，三個戰(zhàn)爭孤兒只穿著單薄的衣服,，蹲在雨地里瑟瑟發(fā)抖，饑寒交迫,。自來也想到正是因為木葉這種大勢力發(fā)動戰(zhàn)爭,，才讓雨隱村的無辜百姓受連累。于是自來也抱著彌補戰(zhàn)爭創(chuàng)傷的期望,，獨自留下照顧他們?nèi)齻€孩子,。而這三個孩子的名字分別叫做彌彥、小南,、長門,！
三忍帶著三百名忍者，回來時只剩下綱手,、大蛇丸倆人了,。猿飛日斬在知道自來也不愿意回木葉村后，心里充滿了遺憾,，但又沒法勸說他,。
猿飛日斬得知山椒魚半藏稱呼綱手他們?yōu)槟救~三忍,，作為戰(zhàn)勝國肯定需要拿出功績吹捧一番，于是命令暗部等成員四處散布消息,。
這一下木葉三忍以及旗木家的木葉獠牙的稱呼,，在整個忍界家喻戶曉?？上攵@五人回到木葉村以后,，一定會被當做木葉英雄對待。
此次雨隱村的戰(zhàn)爭雖然沒有打敗山椒魚半藏,，不過也無所謂了,，后面各村的影會談時，自然會要求雨隱村賠償各村的經(jīng)濟損失,。
至此,，歷時兩年的爭斗，第二次忍界大戰(zhàn),，正式結(jié)束,！