第一百零五章 生命禁區(qū)
果然,,一切都充滿“驚喜”,。
邁過那道加大加寬的黃色屏蔽門后,映入眼簾的是四個(gè)紅色大橫幅,,上面寫著:
頭上懸著三把劍:
如何逆轉(zhuǎn)非編碼區(qū)基因變異進(jìn)程,?
腺病毒究竟如何通過影響非編碼RNA影響植物,?
倒計(jì)時(shí)2555天。
盧赫掐著指頭算了算,,2555天差不多是7年,。
不是還有13年嗎,怎么還縮水了呢,?這可不是什么好消息,。
滿腹狐疑地經(jīng)過那套熟悉的復(fù)雜流程,他來到了實(shí)驗(yàn)室內(nèi),,明亮的燈光刺得他睜不開眼睛,。
這些鑲嵌在吊頂上的巨大燈管,散發(fā)著一種奇異的色彩,。他很久沒見到過如此通透的白色了。
適應(yīng)了光線之后,,他發(fā)現(xiàn)在一排空蕩蕩的生物安全柜前站著一個(gè)熟悉而陌生的身影,,正抬頭直視著頭頂?shù)臒艄埽吹煤苋肷瘛?p> 他悄悄走過去,,繞到對(duì)方側(cè)面,,果然是一張熟悉的臉。
“你又挺過來了,?可喜可賀啊,。”他忍不住調(diào)侃道,。即便在知道事情原委之后,,他早已對(duì)曾經(jīng)把他給折騰不輕的事情釋然了,但面對(duì)眼前的枯槁小老頭,,還是沒忍住,。
對(duì)方?jīng)]有回應(yīng)他,依然抬頭望著燈,,自顧自地說:“看到這些純白色的燈了嗎,?多么純凈的顏色?!?p> “日光燈誰沒見過,?汞蒸氣產(chǎn)生紫外光,紫外光轟擊熒光粉后的二級(jí)光子,,就是純凈的白光,。好看舒服但是費(fèi)電,奢侈,!”盧赫忍不住批判,。
對(duì)方搖了搖頭,,“這可不是日光燈,而是節(jié)能LED,。藍(lán)色自發(fā)光材料的催化過程被攻克了,,全光譜LED已經(jīng)開始量產(chǎn)。即便維持能源現(xiàn)狀,,以后所有人也都能擁有燈光自由,。”
盧赫不以為然地點(diǎn)了點(diǎn)頭,。他對(duì)這些并不感冒,,心里滿滿都是對(duì)7年倒計(jì)時(shí)的疑惑,“門口的標(biāo)語看到了吧,,倒計(jì)時(shí)只有7年,,為什么?”
對(duì)方把目光投在盧赫臉上,,緩緩開口:“因?yàn)槲覐淖詈笠淮伪痪庉?,到第一次發(fā)病,期間間隔了7年多,?!?p> 盧赫愣了一下,“我們的基因相似度大概還剩99.6%,,你的現(xiàn)在是多少,?”
“時(shí)間太久遠(yuǎn),我無法考究到我的原始基因組,,我目前的基因組和時(shí)間間隔最久的一次,,相似度是99.2%?!?p> “呦呵,,那海總您要保重啊,,再過幾個(gè)月,,你和最初的你說不定就生殖隔離了!”
對(duì)方的臉上飄過一絲無奈,,“我正好要找你,,我們正在建立數(shù)據(jù)集,需要我盡可能多的基因組數(shù)據(jù),。2年前你跑到我公司揪下來的我的頭發(fā),,還有沒有?”
盧赫轉(zhuǎn)了轉(zhuǎn)眼珠,,“沒了,,不過我可能還有測序結(jié)果,,在我家里放著?!?p> “放哪里了,,我讓人去取一下?!睂?duì)方語氣驚喜,。
“沒必要?!北R赫回憶起往事,,“我當(dāng)初從你頭發(fā)里提了三組基因,分別寄給三個(gè)公司測序,,其中就有你們公司,。你調(diào)下數(shù)據(jù)就行?!?p> “找過了,,沒有??赡艽笸k姷臅r(shí)候,損失了,?!?p> 盧赫無奈道:“我能先問下你們目前是什么思路嗎?你要搞機(jī)器學(xué)習(xí),?那種不可解釋的黑箱,,有用嗎?”
對(duì)方點(diǎn)頭認(rèn)可,,“沒錯(cuò),,我們就是要做機(jī)器學(xué)習(xí),而且是具備可解釋性的小樣本機(jī)器學(xué)習(xí),。至于你說的黑箱,,就算有些方法是黑箱,但好用就行了,。
你們之前用的CRISPR脫靶分析軟件,,其實(shí)就用了這種技術(shù)。那是巨硬亞洲研究院前幾年的成果,。
他們建立了一個(gè)大型的數(shù)據(jù)集,,記錄了與給定的向?qū)NA有一項(xiàng)核苷酸不匹配的所有可能的標(biāo)靶區(qū)域里發(fā)生的脫靶活動(dòng)。
然后把數(shù)據(jù)喂給了一個(gè)兩個(gè)隱藏層的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),,訓(xùn)練出了一個(gè)可以輸出所有潛在脫靶位點(diǎn)的模型,。這是一個(gè)生成模型,,可以得到每個(gè)脫靶位點(diǎn)的概率,據(jù)此計(jì)算脫靶評(píng)分,?!?p> “太普通了,這只是實(shí)現(xiàn)了一個(gè)二線工具,,還有沒有更驚艷的,?”盧赫追問。
“有,。
非同源末端連接機(jī)制還記得吧,?剪刀剪完基因序列后,不管三七二十一直接把斷裂的基因給粘起來,。
這種方式并不常用,,一般都是用同源模板修復(fù)。一方面是剪的時(shí)候可能剪了不止一個(gè)地方,,粘的時(shí)候卻可能只粘了其中一個(gè),。另一方面是細(xì)胞不樂意了直接就不粘了。
但有團(tuán)隊(duì)利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法準(zhǔn)確地預(yù)測到了細(xì)胞容易修復(fù)的基因位點(diǎn),,并用CRISPR和非同源末端連接治了病,。
為了探索具有代表性的人類基因組序列的修復(fù)產(chǎn)物,他們?cè)O(shè)計(jì)了一千多個(gè)目標(biāo)位點(diǎn),,特征是向?qū)NA和靶標(biāo)基因,,標(biāo)簽是非同源末端連接最終起了修復(fù)作用位點(diǎn)。
數(shù)據(jù)喂給了一個(gè)看起來結(jié)構(gòu)很復(fù)雜的模型,,訓(xùn)練結(jié)果很是喜人,,模型對(duì)11%的向?qū)NA的修復(fù)位點(diǎn)的預(yù)測準(zhǔn)確率在50%以上。
意味著這些向?qū)NA和相應(yīng)靶標(biāo)基因所對(duì)應(yīng)的疾病,,可以用這種方式來治療,。
最終他們治愈了赫曼斯基-普德拉克綜合征,一種能凝血不足和白化病的遺傳病,。體外測試的修復(fù)準(zhǔn)確率高達(dá)94%,。
這個(gè)夠驚艷嗎?”
盧赫連連點(diǎn)頭,,“夠,。這個(gè)思路不錯(cuò),是不是可以用在你身上,,特征是某時(shí)間點(diǎn)的基因組,,標(biāo)簽是未來的變異位點(diǎn),提前預(yù)測變異,在發(fā)病前做修復(fù),?”
“沒錯(cuò),。”對(duì)方肯定道,。
“可是這種方式,,用在你一個(gè)人身上好說,其他人呢,?萬一我們未來都要跟你一樣,,總不能每個(gè)人都建一個(gè)模型吧?”
“也不是不可以,。不過還是希望未來有別的辦法,。這個(gè)思路已經(jīng)被提上日程了,底下四層全是測序中心的地盤,?!?p> 盧赫露出了難以置信的表情,繼而又滿懷期待地追問,,“也不對(duì)啊,,我記得我當(dāng)初給你測序的時(shí)候,你突變的位點(diǎn)很多都在編碼區(qū)的,。也許我們和你不一樣,。”
“沒太大差別,,前期確實(shí)大都在編碼區(qū),,但后來也往非編碼區(qū)發(fā)展了。
非編碼區(qū)早就不是最初認(rèn)知中的“垃圾”區(qū),,隨著研究的推進(jìn),它的重要作用也被逐漸揭示,。之所以我年紀(jì)越大越嚴(yán)重,,很可能就是因?yàn)楹笃谕蛔冊(cè)诹朔蔷幋a區(qū)。
很顯然,,那里不是可以隨意落筆的空白畫布,,而是地獄的入口,是禁區(qū),?!?p> 對(duì)方說完,嘆了一口氣,,便又開始仰頭看燈,,“我的測序結(jié)果放在你家哪里?得盡快派人去取,,樣本本來就不多,,數(shù)據(jù)很珍貴,。”
“不用找別人,,我自己去吧,,我也不確定在不在,在哪里,?!?p> 不一會(huì)兒,他又從鄭K手里弄到了車鑰匙,,還收到了一連串的囑咐:
四通八達(dá)的隧道只限本市,,去外市有一段路要走地上。
除了第110號(hào)掩體以外,,其余的都還沒有下移動(dòng)通訊網(wǎng)絡(luò),,沒法定位,需要熟記地圖,。
這兩天天氣不錯(cuò),,風(fēng)不大,能見度好,,路上也沒人,。但別開太快,路面有沙子,,滑,。
出去之前,找后勤給車上加點(diǎn)配重,。